Protein–RNA interactions for Protein: P25391

LAMA1, Laminin subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 3,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA1P25391 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LAMA1P25391 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
LAMA1P25391 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
LAMA1P25391 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LAMA1P25391 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LAMA1P25391 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LAMA1P25391 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LAMA1P25391 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LAMA1P25391 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LAMA1P25391 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LAMA1P25391 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LAMA1P25391 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LAMA1P25391 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LAMA1P25391 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LAMA1P25391 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LAMA1P25391 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LAMA1P25391 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LAMA1P25391 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LAMA1P25391 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LAMA1P25391 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LAMA1P25391 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LAMA1P25391 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LAMA1P25391 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LAMA1P25391 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LAMA1P25391 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LAMA1P25391 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LAMA1P25391 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LAMA1P25391 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LAMA1P25391 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LAMA1P25391 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
LAMA1P25391 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LAMA1P25391 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LAMA1P25391 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LAMA1P25391 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LAMA1P25391 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LAMA1P25391 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
LAMA1P25391 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LAMA1P25391 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LAMA1P25391 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
LAMA1P25391 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LAMA1P25391 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LAMA1P25391 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LAMA1P25391 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LAMA1P25391 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LAMA1P25391 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LAMA1P25391 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LAMA1P25391 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LAMA1P25391 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LAMA1P25391 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LAMA1P25391 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LAMA1P25391 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
LAMA1P25391 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LAMA1P25391 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LAMA1P25391 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LAMA1P25391 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LAMA1P25391 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LAMA1P25391 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LAMA1P25391 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LAMA1P25391 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LAMA1P25391 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LAMA1P25391 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
LAMA1P25391 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LAMA1P25391 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LAMA1P25391 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LAMA1P25391 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LAMA1P25391 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LAMA1P25391 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LAMA1P25391 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LAMA1P25391 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LAMA1P25391 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LAMA1P25391 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LAMA1P25391 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LAMA1P25391 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LAMA1P25391 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LAMA1P25391 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LAMA1P25391 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LAMA1P25391 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LAMA1P25391 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LAMA1P25391 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LAMA1P25391 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LAMA1P25391 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LAMA1P25391 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LAMA1P25391 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LAMA1P25391 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LAMA1P25391 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LAMA1P25391 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LAMA1P25391 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LAMA1P25391 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LAMA1P25391 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LAMA1P25391 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
LAMA1P25391 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LAMA1P25391 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
LAMA1P25391 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LAMA1P25391 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LAMA1P25391 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LAMA1P25391 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LAMA1P25391 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LAMA1P25391 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
LAMA1P25391 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LAMA1P25391 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms