Protein–RNA interactions for Protein: P20851

C4BPB, C4b-binding protein beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BPBP20851 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4BPBP20851 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4BPBP20851 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4BPBP20851 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4BPBP20851 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4BPBP20851 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4BPBP20851 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4BPBP20851 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4BPBP20851 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4BPBP20851 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4BPBP20851 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4BPBP20851 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4BPBP20851 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4BPBP20851 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4BPBP20851 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4BPBP20851 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4BPBP20851 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4BPBP20851 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4BPBP20851 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4BPBP20851 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4BPBP20851 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4BPBP20851 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4BPBP20851 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4BPBP20851 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4BPBP20851 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4BPBP20851 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4BPBP20851 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C4BPBP20851 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
C4BPBP20851 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C4BPBP20851 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C4BPBP20851 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C4BPBP20851 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C4BPBP20851 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C4BPBP20851 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C4BPBP20851 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C4BPBP20851 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C4BPBP20851 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C4BPBP20851 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C4BPBP20851 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C4BPBP20851 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C4BPBP20851 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
C4BPBP20851 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C4BPBP20851 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C4BPBP20851 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C4BPBP20851 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C4BPBP20851 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C4BPBP20851 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
C4BPBP20851 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
C4BPBP20851 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C4BPBP20851 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C4BPBP20851 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C4BPBP20851 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C4BPBP20851 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C4BPBP20851 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C4BPBP20851 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C4BPBP20851 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4BPBP20851 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4BPBP20851 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4BPBP20851 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4BPBP20851 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4BPBP20851 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4BPBP20851 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4BPBP20851 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4BPBP20851 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4BPBP20851 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4BPBP20851 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4BPBP20851 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4BPBP20851 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4BPBP20851 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4BPBP20851 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4BPBP20851 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
C4BPBP20851 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4BPBP20851 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4BPBP20851 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4BPBP20851 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4BPBP20851 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4BPBP20851 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4BPBP20851 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4BPBP20851 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4BPBP20851 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4BPBP20851 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4BPBP20851 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4BPBP20851 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4BPBP20851 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4BPBP20851 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4BPBP20851 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4BPBP20851 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4BPBP20851 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4BPBP20851 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4BPBP20851 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4BPBP20851 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4BPBP20851 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4BPBP20851 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4BPBP20851 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4BPBP20851 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4BPBP20851 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4BPBP20851 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4BPBP20851 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4BPBP20851 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms