Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms