Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ODC1P11926 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ODC1P11926 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ODC1P11926 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ODC1P11926 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ODC1P11926 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ODC1P11926 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ODC1P11926 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ODC1P11926 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ODC1P11926 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ODC1P11926 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ODC1P11926 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ODC1P11926 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ODC1P11926 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ODC1P11926 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ODC1P11926 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ODC1P11926 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ODC1P11926 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ODC1P11926 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ODC1P11926 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ODC1P11926 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ODC1P11926 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ODC1P11926 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ODC1P11926 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ODC1P11926 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ODC1P11926 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ODC1P11926 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ODC1P11926 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ODC1P11926 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ODC1P11926 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ODC1P11926 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ODC1P11926 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ODC1P11926 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ODC1P11926 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ODC1P11926 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ODC1P11926 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ODC1P11926 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ODC1P11926 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ODC1P11926 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ODC1P11926 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ODC1P11926 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ODC1P11926 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ODC1P11926 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ODC1P11926 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ODC1P11926 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ODC1P11926 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ODC1P11926 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ODC1P11926 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ODC1P11926 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ODC1P11926 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ODC1P11926 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ODC1P11926 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ODC1P11926 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ODC1P11926 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ODC1P11926 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ODC1P11926 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ODC1P11926 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ODC1P11926 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ODC1P11926 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ODC1P11926 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ODC1P11926 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ODC1P11926 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ODC1P11926 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ODC1P11926 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ODC1P11926 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ODC1P11926 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ODC1P11926 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ODC1P11926 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ODC1P11926 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ODC1P11926 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ODC1P11926 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ODC1P11926 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ODC1P11926 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ODC1P11926 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ODC1P11926 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ODC1P11926 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ODC1P11926 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ODC1P11926 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ODC1P11926 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ODC1P11926 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ODC1P11926 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ODC1P11926 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ODC1P11926 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ODC1P11926 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ODC1P11926 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ODC1P11926 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ODC1P11926 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ODC1P11926 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ODC1P11926 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ODC1P11926 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ODC1P11926 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ODC1P11926 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ODC1P11926 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ODC1P11926 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ODC1P11926 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ODC1P11926 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ODC1P11926 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ODC1P11926 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ODC1P11926 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ODC1P11926 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms