Protein–RNA interactions for Protein: P0DI82

TRAPPC2B, Trafficking protein particle complex subunit 2B, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2BP0DI82 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms