Protein–RNA interactions for Protein: P0C7M3

SFTA3, Surfactant-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTA3P0C7M3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SFTA3P0C7M3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SFTA3P0C7M3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SFTA3P0C7M3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SFTA3P0C7M3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SFTA3P0C7M3 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SFTA3P0C7M3 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SFTA3P0C7M3 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SFTA3P0C7M3 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SFTA3P0C7M3 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SFTA3P0C7M3 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SFTA3P0C7M3 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SFTA3P0C7M3 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SFTA3P0C7M3 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SFTA3P0C7M3 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SFTA3P0C7M3 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SFTA3P0C7M3 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SFTA3P0C7M3 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SFTA3P0C7M3 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SFTA3P0C7M3 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFTA3P0C7M3 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFTA3P0C7M3 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFTA3P0C7M3 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFTA3P0C7M3 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SFTA3P0C7M3 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SFTA3P0C7M3 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFTA3P0C7M3 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFTA3P0C7M3 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFTA3P0C7M3 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SFTA3P0C7M3 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SFTA3P0C7M3 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SFTA3P0C7M3 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SFTA3P0C7M3 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SFTA3P0C7M3 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFTA3P0C7M3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SFTA3P0C7M3 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SFTA3P0C7M3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SFTA3P0C7M3 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SFTA3P0C7M3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SFTA3P0C7M3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SFTA3P0C7M3 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SFTA3P0C7M3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SFTA3P0C7M3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFTA3P0C7M3 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFTA3P0C7M3 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SFTA3P0C7M3 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SFTA3P0C7M3 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFTA3P0C7M3 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFTA3P0C7M3 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SFTA3P0C7M3 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFTA3P0C7M3 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SFTA3P0C7M3 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFTA3P0C7M3 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFTA3P0C7M3 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SFTA3P0C7M3 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SFTA3P0C7M3 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFTA3P0C7M3 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SFTA3P0C7M3 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFTA3P0C7M3 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SFTA3P0C7M3 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SFTA3P0C7M3 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SFTA3P0C7M3 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFTA3P0C7M3 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFTA3P0C7M3 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFTA3P0C7M3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFTA3P0C7M3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SFTA3P0C7M3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SFTA3P0C7M3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SFTA3P0C7M3 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SFTA3P0C7M3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SFTA3P0C7M3 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SFTA3P0C7M3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SFTA3P0C7M3 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SFTA3P0C7M3 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFTA3P0C7M3 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SFTA3P0C7M3 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SFTA3P0C7M3 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SFTA3P0C7M3 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SFTA3P0C7M3 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SFTA3P0C7M3 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SFTA3P0C7M3 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFTA3P0C7M3 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFTA3P0C7M3 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFTA3P0C7M3 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFTA3P0C7M3 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SFTA3P0C7M3 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFTA3P0C7M3 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SFTA3P0C7M3 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFTA3P0C7M3 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFTA3P0C7M3 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFTA3P0C7M3 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SFTA3P0C7M3 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SFTA3P0C7M3 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SFTA3P0C7M3 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SFTA3P0C7M3 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SFTA3P0C7M3 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SFTA3P0C7M3 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SFTA3P0C7M3 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SFTA3P0C7M3 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SFTA3P0C7M3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms