Protein–RNA interactions for Protein: P08238

HSP90AB1, Heat shock protein HSP 90-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB1P08238 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HSP90AB1P08238 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HSP90AB1P08238 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
HSP90AB1P08238 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HSP90AB1P08238 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HSP90AB1P08238 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HSP90AB1P08238 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HSP90AB1P08238 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HSP90AB1P08238 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HSP90AB1P08238 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HSP90AB1P08238 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HSP90AB1P08238 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HSP90AB1P08238 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HSP90AB1P08238 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HSP90AB1P08238 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HSP90AB1P08238 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HSP90AB1P08238 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HSP90AB1P08238 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HSP90AB1P08238 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HSP90AB1P08238 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HSP90AB1P08238 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
HSP90AB1P08238 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HSP90AB1P08238 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
HSP90AB1P08238 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HSP90AB1P08238 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HSP90AB1P08238 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HSP90AB1P08238 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
HSP90AB1P08238 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
HSP90AB1P08238 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HSP90AB1P08238 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
HSP90AB1P08238 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HSP90AB1P08238 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HSP90AB1P08238 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HSP90AB1P08238 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HSP90AB1P08238 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HSP90AB1P08238 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HSP90AB1P08238 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HSP90AB1P08238 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HSP90AB1P08238 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HSP90AB1P08238 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HSP90AB1P08238 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
HSP90AB1P08238 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HSP90AB1P08238 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HSP90AB1P08238 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HSP90AB1P08238 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HSP90AB1P08238 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HSP90AB1P08238 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HSP90AB1P08238 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HSP90AB1P08238 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HSP90AB1P08238 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HSP90AB1P08238 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HSP90AB1P08238 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HSP90AB1P08238 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HSP90AB1P08238 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HSP90AB1P08238 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HSP90AB1P08238 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HSP90AB1P08238 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
HSP90AB1P08238 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HSP90AB1P08238 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HSP90AB1P08238 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HSP90AB1P08238 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HSP90AB1P08238 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HSP90AB1P08238 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HSP90AB1P08238 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HSP90AB1P08238 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HSP90AB1P08238 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HSP90AB1P08238 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HSP90AB1P08238 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HSP90AB1P08238 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HSP90AB1P08238 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HSP90AB1P08238 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HSP90AB1P08238 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HSP90AB1P08238 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HSP90AB1P08238 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HSP90AB1P08238 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HSP90AB1P08238 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HSP90AB1P08238 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
HSP90AB1P08238 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HSP90AB1P08238 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HSP90AB1P08238 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
HSP90AB1P08238 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
HSP90AB1P08238 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HSP90AB1P08238 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HSP90AB1P08238 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HSP90AB1P08238 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
HSP90AB1P08238 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HSP90AB1P08238 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HSP90AB1P08238 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HSP90AB1P08238 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HSP90AB1P08238 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HSP90AB1P08238 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HSP90AB1P08238 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HSP90AB1P08238 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HSP90AB1P08238 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HSP90AB1P08238 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HSP90AB1P08238 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HSP90AB1P08238 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HSP90AB1P08238 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HSP90AB1P08238 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HSP90AB1P08238 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms