Protein–RNA interactions for Protein: P01568

IFNA21, Interferon alpha-21, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA21P01568 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFNA21P01568 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFNA21P01568 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFNA21P01568 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFNA21P01568 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFNA21P01568 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
IFNA21P01568 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFNA21P01568 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFNA21P01568 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFNA21P01568 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFNA21P01568 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFNA21P01568 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFNA21P01568 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFNA21P01568 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFNA21P01568 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFNA21P01568 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFNA21P01568 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFNA21P01568 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFNA21P01568 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFNA21P01568 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFNA21P01568 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFNA21P01568 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFNA21P01568 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFNA21P01568 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFNA21P01568 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFNA21P01568 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFNA21P01568 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFNA21P01568 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFNA21P01568 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFNA21P01568 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFNA21P01568 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFNA21P01568 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFNA21P01568 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFNA21P01568 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFNA21P01568 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFNA21P01568 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFNA21P01568 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFNA21P01568 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFNA21P01568 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFNA21P01568 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFNA21P01568 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFNA21P01568 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFNA21P01568 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFNA21P01568 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFNA21P01568 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFNA21P01568 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFNA21P01568 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFNA21P01568 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFNA21P01568 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFNA21P01568 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFNA21P01568 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFNA21P01568 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFNA21P01568 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFNA21P01568 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFNA21P01568 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFNA21P01568 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFNA21P01568 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFNA21P01568 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFNA21P01568 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
IFNA21P01568 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFNA21P01568 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFNA21P01568 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFNA21P01568 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFNA21P01568 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFNA21P01568 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFNA21P01568 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFNA21P01568 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFNA21P01568 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFNA21P01568 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFNA21P01568 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFNA21P01568 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFNA21P01568 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFNA21P01568 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFNA21P01568 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFNA21P01568 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFNA21P01568 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFNA21P01568 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA21P01568 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA21P01568 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA21P01568 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA21P01568 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA21P01568 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA21P01568 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA21P01568 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA21P01568 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA21P01568 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA21P01568 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA21P01568 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA21P01568 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA21P01568 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA21P01568 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA21P01568 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA21P01568 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA21P01568 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA21P01568 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA21P01568 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA21P01568 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA21P01568 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA21P01568 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA21P01568 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms