Protein–RNA interactions for Protein: P00480

OTC, Ornithine carbamoyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTCP00480 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
OTCP00480 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
OTCP00480 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTCP00480 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTCP00480 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTCP00480 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTCP00480 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
OTCP00480 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTCP00480 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTCP00480 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
OTCP00480 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTCP00480 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTCP00480 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTCP00480 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTCP00480 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTCP00480 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTCP00480 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTCP00480 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTCP00480 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTCP00480 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTCP00480 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTCP00480 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTCP00480 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTCP00480 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTCP00480 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTCP00480 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTCP00480 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTCP00480 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
OTCP00480 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
OTCP00480 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTCP00480 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTCP00480 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTCP00480 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTCP00480 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTCP00480 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTCP00480 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
OTCP00480 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTCP00480 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTCP00480 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTCP00480 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTCP00480 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTCP00480 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTCP00480 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
OTCP00480 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTCP00480 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTCP00480 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTCP00480 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTCP00480 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTCP00480 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTCP00480 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTCP00480 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTCP00480 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTCP00480 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTCP00480 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTCP00480 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTCP00480 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTCP00480 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTCP00480 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTCP00480 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTCP00480 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTCP00480 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTCP00480 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTCP00480 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
OTCP00480 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTCP00480 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTCP00480 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTCP00480 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTCP00480 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTCP00480 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTCP00480 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTCP00480 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTCP00480 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTCP00480 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTCP00480 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTCP00480 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTCP00480 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTCP00480 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTCP00480 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTCP00480 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTCP00480 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTCP00480 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTCP00480 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTCP00480 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
OTCP00480 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTCP00480 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTCP00480 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTCP00480 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
OTCP00480 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTCP00480 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTCP00480 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTCP00480 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTCP00480 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTCP00480 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTCP00480 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTCP00480 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTCP00480 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTCP00480 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTCP00480 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTCP00480 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTCP00480 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms