Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN9O95484 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN9O95484 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN9O95484 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN9O95484 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN9O95484 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN9O95484 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN9O95484 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN9O95484 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN9O95484 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN9O95484 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN9O95484 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN9O95484 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN9O95484 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN9O95484 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN9O95484 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN9O95484 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN9O95484 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN9O95484 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN9O95484 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN9O95484 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN9O95484 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN9O95484 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN9O95484 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN9O95484 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN9O95484 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN9O95484 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN9O95484 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN9O95484 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN9O95484 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN9O95484 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN9O95484 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN9O95484 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN9O95484 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN9O95484 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN9O95484 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN9O95484 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN9O95484 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN9O95484 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN9O95484 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN9O95484 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN9O95484 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN9O95484 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN9O95484 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN9O95484 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN9O95484 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN9O95484 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN9O95484 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN9O95484 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN9O95484 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN9O95484 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN9O95484 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN9O95484 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN9O95484 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN9O95484 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN9O95484 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN9O95484 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN9O95484 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN9O95484 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN9O95484 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN9O95484 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN9O95484 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN9O95484 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN9O95484 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN9O95484 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN9O95484 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN9O95484 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN9O95484 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN9O95484 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN9O95484 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN9O95484 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN9O95484 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN9O95484 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN9O95484 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN9O95484 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN9O95484 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN9O95484 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN9O95484 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN9O95484 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN9O95484 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN9O95484 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN9O95484 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN9O95484 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN9O95484 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN9O95484 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN9O95484 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN9O95484 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN9O95484 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN9O95484 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN9O95484 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN9O95484 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN9O95484 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN9O95484 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN9O95484 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN9O95484 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN9O95484 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN9O95484 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN9O95484 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN9O95484 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN9O95484 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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