Protein–RNA interactions for Protein: O75923

DYSF, Dysferlin, humanhuman

Predictions only

Length 2,080 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYSFO75923 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DYSFO75923 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DYSFO75923 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DYSFO75923 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DYSFO75923 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DYSFO75923 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DYSFO75923 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DYSFO75923 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DYSFO75923 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DYSFO75923 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DYSFO75923 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DYSFO75923 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DYSFO75923 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DYSFO75923 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DYSFO75923 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DYSFO75923 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DYSFO75923 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DYSFO75923 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DYSFO75923 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DYSFO75923 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
DYSFO75923 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DYSFO75923 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DYSFO75923 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DYSFO75923 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DYSFO75923 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DYSFO75923 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DYSFO75923 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DYSFO75923 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DYSFO75923 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DYSFO75923 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DYSFO75923 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DYSFO75923 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DYSFO75923 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DYSFO75923 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DYSFO75923 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DYSFO75923 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DYSFO75923 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DYSFO75923 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DYSFO75923 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DYSFO75923 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DYSFO75923 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DYSFO75923 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DYSFO75923 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DYSFO75923 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DYSFO75923 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DYSFO75923 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DYSFO75923 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DYSFO75923 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DYSFO75923 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
DYSFO75923 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
DYSFO75923 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DYSFO75923 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DYSFO75923 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DYSFO75923 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DYSFO75923 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DYSFO75923 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DYSFO75923 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DYSFO75923 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DYSFO75923 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DYSFO75923 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DYSFO75923 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DYSFO75923 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DYSFO75923 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DYSFO75923 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DYSFO75923 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
DYSFO75923 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DYSFO75923 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DYSFO75923 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DYSFO75923 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DYSFO75923 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DYSFO75923 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DYSFO75923 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DYSFO75923 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
DYSFO75923 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DYSFO75923 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DYSFO75923 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DYSFO75923 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DYSFO75923 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DYSFO75923 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DYSFO75923 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DYSFO75923 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DYSFO75923 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DYSFO75923 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DYSFO75923 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DYSFO75923 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DYSFO75923 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DYSFO75923 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DYSFO75923 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DYSFO75923 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DYSFO75923 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DYSFO75923 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
DYSFO75923 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DYSFO75923 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DYSFO75923 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DYSFO75923 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DYSFO75923 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DYSFO75923 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DYSFO75923 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DYSFO75923 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
DYSFO75923 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms