Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPFIA3O75145 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPFIA3O75145 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPFIA3O75145 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPFIA3O75145 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPFIA3O75145 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms