Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCN2BO60939 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCN2BO60939 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCN2BO60939 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCN2BO60939 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCN2BO60939 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCN2BO60939 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCN2BO60939 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCN2BO60939 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCN2BO60939 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCN2BO60939 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCN2BO60939 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCN2BO60939 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCN2BO60939 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCN2BO60939 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCN2BO60939 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCN2BO60939 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SCN2BO60939 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCN2BO60939 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCN2BO60939 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCN2BO60939 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCN2BO60939 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCN2BO60939 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCN2BO60939 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCN2BO60939 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCN2BO60939 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SCN2BO60939 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SCN2BO60939 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SCN2BO60939 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SCN2BO60939 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SCN2BO60939 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SCN2BO60939 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SCN2BO60939 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SCN2BO60939 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SCN2BO60939 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms