Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
ABCC9O60706 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
ABCC9O60706 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
ABCC9O60706 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
ABCC9O60706 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC37.27■■■■□ 3.56
ABCC9O60706 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC37.27■■■■□ 3.56
ABCC9O60706 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
ABCC9O60706 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
ABCC9O60706 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
ABCC9O60706 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
ABCC9O60706 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
ABCC9O60706 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.56
ABCC9O60706 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
ABCC9O60706 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.56
ABCC9O60706 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
ABCC9O60706 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC37.26■■■■□ 3.56
ABCC9O60706 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC37.26■■■■□ 3.56
ABCC9O60706 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
ABCC9O60706 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC37.26■■■■□ 3.56
ABCC9O60706 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
ABCC9O60706 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.56
ABCC9O60706 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
ABCC9O60706 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.55
ABCC9O60706 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
ABCC9O60706 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC37.26■■■■□ 3.55
ABCC9O60706 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC37.26■■■■□ 3.55
ABCC9O60706 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.55
ABCC9O60706 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC37.26■■■■□ 3.55
ABCC9O60706 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
ABCC9O60706 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.55
ABCC9O60706 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC37.25■■■■□ 3.55
ABCC9O60706 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
ABCC9O60706 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
ABCC9O60706 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
ABCC9O60706 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
ABCC9O60706 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
ABCC9O60706 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
ABCC9O60706 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
ABCC9O60706 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
ABCC9O60706 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
ABCC9O60706 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC37.25■■■■□ 3.55
ABCC9O60706 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC37.25■■■■□ 3.55
ABCC9O60706 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC37.25■■■■□ 3.55
ABCC9O60706 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
ABCC9O60706 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC37.25■■■■□ 3.55
ABCC9O60706 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
ABCC9O60706 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
ABCC9O60706 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
ABCC9O60706 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC37.24■■■■□ 3.55
ABCC9O60706 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
ABCC9O60706 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
ABCC9O60706 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
ABCC9O60706 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC37.24■■■■□ 3.55
ABCC9O60706 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
ABCC9O60706 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
ABCC9O60706 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
ABCC9O60706 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
ABCC9O60706 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
ABCC9O60706 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC37.23■■■■□ 3.55
ABCC9O60706 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
ABCC9O60706 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
ABCC9O60706 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
ABCC9O60706 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
ABCC9O60706 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
ABCC9O60706 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
ABCC9O60706 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC37.22■■■■□ 3.55
ABCC9O60706 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC37.22■■■■□ 3.55
ABCC9O60706 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
ABCC9O60706 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
ABCC9O60706 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
ABCC9O60706 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC37.22■■■■□ 3.55
ABCC9O60706 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
ABCC9O60706 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
ABCC9O60706 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
ABCC9O60706 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
ABCC9O60706 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
ABCC9O60706 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
ABCC9O60706 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
ABCC9O60706 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
ABCC9O60706 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
ABCC9O60706 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
ABCC9O60706 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC37.2■■■■□ 3.55
ABCC9O60706 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC37.2■■■■□ 3.55
ABCC9O60706 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
ABCC9O60706 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
ABCC9O60706 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
ABCC9O60706 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
ABCC9O60706 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
ABCC9O60706 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
ABCC9O60706 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
ABCC9O60706 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
ABCC9O60706 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
ABCC9O60706 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
ABCC9O60706 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC37.2■■■■□ 3.55
ABCC9O60706 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
ABCC9O60706 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
ABCC9O60706 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC37.19■■■■□ 3.54
ABCC9O60706 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC37.19■■■■□ 3.54
ABCC9O60706 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC37.19■■■■□ 3.54
ABCC9O60706 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms