Protein–RNA interactions for Protein: O43924

PDE6D, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6DO43924 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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PDE6DO43924 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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PDE6DO43924 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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PDE6DO43924 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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PDE6DO43924 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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PDE6DO43924 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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PDE6DO43924 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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PDE6DO43924 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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PDE6DO43924 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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