Protein–RNA interactions for Protein: O15524

SOCS1, Suppressor of cytokine signaling 1, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS1O15524 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOCS1O15524 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms