Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms