Protein–RNA interactions for Protein: O15034

RIMBP2, RIMS-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMBP2O15034 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIMBP2O15034 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIMBP2O15034 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIMBP2O15034 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIMBP2O15034 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIMBP2O15034 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIMBP2O15034 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIMBP2O15034 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIMBP2O15034 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RIMBP2O15034 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIMBP2O15034 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIMBP2O15034 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIMBP2O15034 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIMBP2O15034 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIMBP2O15034 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIMBP2O15034 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIMBP2O15034 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIMBP2O15034 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIMBP2O15034 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIMBP2O15034 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIMBP2O15034 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIMBP2O15034 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIMBP2O15034 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIMBP2O15034 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIMBP2O15034 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIMBP2O15034 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIMBP2O15034 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIMBP2O15034 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RIMBP2O15034 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIMBP2O15034 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIMBP2O15034 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIMBP2O15034 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RIMBP2O15034 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIMBP2O15034 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RIMBP2O15034 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RIMBP2O15034 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIMBP2O15034 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIMBP2O15034 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIMBP2O15034 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIMBP2O15034 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIMBP2O15034 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIMBP2O15034 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIMBP2O15034 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIMBP2O15034 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIMBP2O15034 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIMBP2O15034 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIMBP2O15034 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIMBP2O15034 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIMBP2O15034 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIMBP2O15034 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIMBP2O15034 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RIMBP2O15034 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIMBP2O15034 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RIMBP2O15034 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIMBP2O15034 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIMBP2O15034 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIMBP2O15034 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIMBP2O15034 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIMBP2O15034 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RIMBP2O15034 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIMBP2O15034 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIMBP2O15034 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIMBP2O15034 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIMBP2O15034 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIMBP2O15034 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIMBP2O15034 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIMBP2O15034 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIMBP2O15034 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIMBP2O15034 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIMBP2O15034 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
RIMBP2O15034 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
RIMBP2O15034 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RIMBP2O15034 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIMBP2O15034 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIMBP2O15034 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIMBP2O15034 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIMBP2O15034 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIMBP2O15034 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIMBP2O15034 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RIMBP2O15034 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RIMBP2O15034 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIMBP2O15034 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIMBP2O15034 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIMBP2O15034 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIMBP2O15034 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIMBP2O15034 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIMBP2O15034 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIMBP2O15034 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIMBP2O15034 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIMBP2O15034 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIMBP2O15034 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIMBP2O15034 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIMBP2O15034 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIMBP2O15034 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIMBP2O15034 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIMBP2O15034 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIMBP2O15034 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RIMBP2O15034 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIMBP2O15034 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIMBP2O15034 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms