Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PTPRTO14522 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PTPRTO14522 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PTPRTO14522 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PTPRTO14522 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PTPRTO14522 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
PTPRTO14522 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
PTPRTO14522 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PTPRTO14522 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PTPRTO14522 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
PTPRTO14522 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PTPRTO14522 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PTPRTO14522 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPRTO14522 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPRTO14522 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPRTO14522 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPRTO14522 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPRTO14522 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPRTO14522 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPRTO14522 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPRTO14522 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPRTO14522 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPRTO14522 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPRTO14522 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPRTO14522 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPRTO14522 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPRTO14522 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPRTO14522 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPRTO14522 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPRTO14522 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPRTO14522 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPRTO14522 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPRTO14522 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPRTO14522 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPRTO14522 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPRTO14522 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPRTO14522 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPRTO14522 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPRTO14522 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPRTO14522 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPRTO14522 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPRTO14522 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPRTO14522 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPRTO14522 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPRTO14522 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPRTO14522 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPRTO14522 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPRTO14522 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPRTO14522 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPRTO14522 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPRTO14522 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPRTO14522 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPRTO14522 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPRTO14522 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPRTO14522 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPRTO14522 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPRTO14522 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPRTO14522 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRTO14522 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRTO14522 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRTO14522 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRTO14522 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRTO14522 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRTO14522 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRTO14522 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRTO14522 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRTO14522 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRTO14522 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRTO14522 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRTO14522 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRTO14522 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRTO14522 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRTO14522 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRTO14522 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRTO14522 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRTO14522 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRTO14522 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRTO14522 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRTO14522 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRTO14522 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRTO14522 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPRTO14522 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPRTO14522 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPRTO14522 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPRTO14522 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPRTO14522 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPRTO14522 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPRTO14522 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPRTO14522 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPRTO14522 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPRTO14522 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPRTO14522 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPRTO14522 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPRTO14522 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPRTO14522 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPRTO14522 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPRTO14522 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPRTO14522 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPRTO14522 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPRTO14522 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
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