Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms