Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SMIM1B2RUZ4 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms