Protein–RNA interactions for Protein: A8MV65

VGLL3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL3A8MV65 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms