Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ27

NEURL1B, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL1BA8MQ27 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEURL1BA8MQ27 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEURL1BA8MQ27 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEURL1BA8MQ27 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEURL1BA8MQ27 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEURL1BA8MQ27 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEURL1BA8MQ27 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEURL1BA8MQ27 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEURL1BA8MQ27 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NEURL1BA8MQ27 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEURL1BA8MQ27 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEURL1BA8MQ27 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEURL1BA8MQ27 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEURL1BA8MQ27 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEURL1BA8MQ27 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEURL1BA8MQ27 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEURL1BA8MQ27 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEURL1BA8MQ27 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEURL1BA8MQ27 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEURL1BA8MQ27 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEURL1BA8MQ27 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEURL1BA8MQ27 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEURL1BA8MQ27 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEURL1BA8MQ27 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEURL1BA8MQ27 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEURL1BA8MQ27 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEURL1BA8MQ27 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEURL1BA8MQ27 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEURL1BA8MQ27 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NEURL1BA8MQ27 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEURL1BA8MQ27 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NEURL1BA8MQ27 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NEURL1BA8MQ27 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NEURL1BA8MQ27 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEURL1BA8MQ27 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEURL1BA8MQ27 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEURL1BA8MQ27 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEURL1BA8MQ27 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEURL1BA8MQ27 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEURL1BA8MQ27 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEURL1BA8MQ27 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEURL1BA8MQ27 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEURL1BA8MQ27 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEURL1BA8MQ27 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEURL1BA8MQ27 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEURL1BA8MQ27 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEURL1BA8MQ27 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEURL1BA8MQ27 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEURL1BA8MQ27 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEURL1BA8MQ27 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEURL1BA8MQ27 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEURL1BA8MQ27 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEURL1BA8MQ27 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEURL1BA8MQ27 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEURL1BA8MQ27 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEURL1BA8MQ27 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEURL1BA8MQ27 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEURL1BA8MQ27 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEURL1BA8MQ27 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEURL1BA8MQ27 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NEURL1BA8MQ27 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEURL1BA8MQ27 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEURL1BA8MQ27 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEURL1BA8MQ27 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEURL1BA8MQ27 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEURL1BA8MQ27 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEURL1BA8MQ27 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEURL1BA8MQ27 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEURL1BA8MQ27 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEURL1BA8MQ27 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEURL1BA8MQ27 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEURL1BA8MQ27 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEURL1BA8MQ27 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEURL1BA8MQ27 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEURL1BA8MQ27 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEURL1BA8MQ27 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEURL1BA8MQ27 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEURL1BA8MQ27 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NEURL1BA8MQ27 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEURL1BA8MQ27 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEURL1BA8MQ27 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEURL1BA8MQ27 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEURL1BA8MQ27 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEURL1BA8MQ27 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEURL1BA8MQ27 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEURL1BA8MQ27 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEURL1BA8MQ27 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEURL1BA8MQ27 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEURL1BA8MQ27 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEURL1BA8MQ27 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEURL1BA8MQ27 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEURL1BA8MQ27 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEURL1BA8MQ27 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEURL1BA8MQ27 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEURL1BA8MQ27 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEURL1BA8MQ27 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEURL1BA8MQ27 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEURL1BA8MQ27 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEURL1BA8MQ27 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEURL1BA8MQ27 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms