Protein–RNA interactions for Protein: A6NNM8

TTLL13P, Tubulin polyglutamylase TTLL13P, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL13PA6NNM8 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TTLL13PA6NNM8 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TTLL13PA6NNM8 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TTLL13PA6NNM8 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TTLL13PA6NNM8 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TTLL13PA6NNM8 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TTLL13PA6NNM8 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TTLL13PA6NNM8 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TTLL13PA6NNM8 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TTLL13PA6NNM8 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TTLL13PA6NNM8 MTND4LP12-201ENST00000448237 295 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TTLL13PA6NNM8 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TTLL13PA6NNM8 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TTLL13PA6NNM8 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TTLL13PA6NNM8 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TTLL13PA6NNM8 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TTLL13PA6NNM8 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TTLL13PA6NNM8 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TTLL13PA6NNM8 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TTLL13PA6NNM8 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TTLL13PA6NNM8 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TTLL13PA6NNM8 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TTLL13PA6NNM8 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TTLL13PA6NNM8 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TTLL13PA6NNM8 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TTLL13PA6NNM8 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TTLL13PA6NNM8 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TTLL13PA6NNM8 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TTLL13PA6NNM8 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TTLL13PA6NNM8 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TTLL13PA6NNM8 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TTLL13PA6NNM8 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TTLL13PA6NNM8 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TTLL13PA6NNM8 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TTLL13PA6NNM8 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TTLL13PA6NNM8 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TTLL13PA6NNM8 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TTLL13PA6NNM8 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TTLL13PA6NNM8 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TTLL13PA6NNM8 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TTLL13PA6NNM8 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TTLL13PA6NNM8 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TTLL13PA6NNM8 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TTLL13PA6NNM8 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TTLL13PA6NNM8 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TTLL13PA6NNM8 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TTLL13PA6NNM8 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TTLL13PA6NNM8 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TTLL13PA6NNM8 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TTLL13PA6NNM8 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TTLL13PA6NNM8 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TTLL13PA6NNM8 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TTLL13PA6NNM8 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TTLL13PA6NNM8 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TTLL13PA6NNM8 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TTLL13PA6NNM8 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TTLL13PA6NNM8 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TTLL13PA6NNM8 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TTLL13PA6NNM8 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TTLL13PA6NNM8 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TTLL13PA6NNM8 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TTLL13PA6NNM8 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TTLL13PA6NNM8 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TTLL13PA6NNM8 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TTLL13PA6NNM8 AL390728.6-201ENST00000566446 1246 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TTLL13PA6NNM8 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TTLL13PA6NNM8 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TTLL13PA6NNM8 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TTLL13PA6NNM8 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TTLL13PA6NNM8 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TTLL13PA6NNM8 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TTLL13PA6NNM8 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TTLL13PA6NNM8 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TTLL13PA6NNM8 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TTLL13PA6NNM8 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TTLL13PA6NNM8 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TTLL13PA6NNM8 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TTLL13PA6NNM8 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TTLL13PA6NNM8 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TTLL13PA6NNM8 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TTLL13PA6NNM8 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TTLL13PA6NNM8 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TTLL13PA6NNM8 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TTLL13PA6NNM8 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TTLL13PA6NNM8 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TTLL13PA6NNM8 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TTLL13PA6NNM8 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TTLL13PA6NNM8 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TTLL13PA6NNM8 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TTLL13PA6NNM8 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TTLL13PA6NNM8 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TTLL13PA6NNM8 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TTLL13PA6NNM8 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TTLL13PA6NNM8 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TTLL13PA6NNM8 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TTLL13PA6NNM8 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TTLL13PA6NNM8 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TTLL13PA6NNM8 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TTLL13PA6NNM8 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TTLL13PA6NNM8 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms