Protein–RNA interactions for Protein: A6NH21

SERINC4, Serine incorporator 4, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC4A6NH21 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SERINC4A6NH21 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SERINC4A6NH21 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SERINC4A6NH21 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SERINC4A6NH21 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SERINC4A6NH21 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SERINC4A6NH21 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SERINC4A6NH21 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SERINC4A6NH21 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SERINC4A6NH21 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SERINC4A6NH21 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SERINC4A6NH21 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SERINC4A6NH21 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SERINC4A6NH21 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SERINC4A6NH21 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SERINC4A6NH21 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SERINC4A6NH21 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SERINC4A6NH21 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SERINC4A6NH21 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SERINC4A6NH21 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SERINC4A6NH21 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SERINC4A6NH21 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SERINC4A6NH21 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SERINC4A6NH21 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SERINC4A6NH21 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SERINC4A6NH21 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SERINC4A6NH21 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SERINC4A6NH21 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SERINC4A6NH21 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SERINC4A6NH21 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SERINC4A6NH21 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SERINC4A6NH21 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SERINC4A6NH21 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SERINC4A6NH21 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SERINC4A6NH21 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SERINC4A6NH21 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SERINC4A6NH21 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SERINC4A6NH21 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SERINC4A6NH21 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SERINC4A6NH21 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SERINC4A6NH21 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SERINC4A6NH21 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SERINC4A6NH21 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SERINC4A6NH21 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SERINC4A6NH21 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SERINC4A6NH21 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SERINC4A6NH21 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SERINC4A6NH21 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SERINC4A6NH21 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SERINC4A6NH21 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SERINC4A6NH21 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SERINC4A6NH21 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SERINC4A6NH21 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SERINC4A6NH21 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SERINC4A6NH21 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SERINC4A6NH21 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SERINC4A6NH21 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SERINC4A6NH21 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SERINC4A6NH21 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SERINC4A6NH21 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SERINC4A6NH21 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SERINC4A6NH21 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SERINC4A6NH21 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SERINC4A6NH21 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SERINC4A6NH21 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SERINC4A6NH21 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SERINC4A6NH21 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SERINC4A6NH21 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SERINC4A6NH21 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SERINC4A6NH21 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SERINC4A6NH21 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SERINC4A6NH21 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SERINC4A6NH21 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SERINC4A6NH21 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SERINC4A6NH21 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SERINC4A6NH21 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SERINC4A6NH21 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SERINC4A6NH21 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SERINC4A6NH21 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SERINC4A6NH21 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SERINC4A6NH21 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SERINC4A6NH21 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SERINC4A6NH21 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SERINC4A6NH21 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SERINC4A6NH21 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SERINC4A6NH21 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SERINC4A6NH21 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SERINC4A6NH21 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SERINC4A6NH21 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SERINC4A6NH21 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SERINC4A6NH21 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SERINC4A6NH21 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SERINC4A6NH21 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SERINC4A6NH21 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SERINC4A6NH21 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
SERINC4A6NH21 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SERINC4A6NH21 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SERINC4A6NH21 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SERINC4A6NH21 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SERINC4A6NH21 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms