Protein–RNA interactions for Protein: A6NDR6

MEIS3P1, Putative homeobox protein Meis3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3P1A6NDR6 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms