Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSDA5PKW4 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSDA5PKW4 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSDA5PKW4 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSDA5PKW4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSDA5PKW4 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSDA5PKW4 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PSDA5PKW4 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSDA5PKW4 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PSDA5PKW4 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSDA5PKW4 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PSDA5PKW4 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSDA5PKW4 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PSDA5PKW4 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSDA5PKW4 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSDA5PKW4 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PSDA5PKW4 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PSDA5PKW4 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PSDA5PKW4 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PSDA5PKW4 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PSDA5PKW4 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PSDA5PKW4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PSDA5PKW4 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PSDA5PKW4 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
PSDA5PKW4 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PSDA5PKW4 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PSDA5PKW4 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PSDA5PKW4 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PSDA5PKW4 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PSDA5PKW4 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PSDA5PKW4 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PSDA5PKW4 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PSDA5PKW4 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PSDA5PKW4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PSDA5PKW4 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PSDA5PKW4 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PSDA5PKW4 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PSDA5PKW4 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PSDA5PKW4 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSDA5PKW4 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSDA5PKW4 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSDA5PKW4 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSDA5PKW4 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSDA5PKW4 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSDA5PKW4 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSDA5PKW4 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSDA5PKW4 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSDA5PKW4 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSDA5PKW4 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSDA5PKW4 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSDA5PKW4 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSDA5PKW4 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSDA5PKW4 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PSDA5PKW4 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSDA5PKW4 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSDA5PKW4 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSDA5PKW4 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSDA5PKW4 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSDA5PKW4 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSDA5PKW4 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PSDA5PKW4 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSDA5PKW4 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSDA5PKW4 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSDA5PKW4 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSDA5PKW4 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSDA5PKW4 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSDA5PKW4 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSDA5PKW4 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSDA5PKW4 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSDA5PKW4 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSDA5PKW4 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSDA5PKW4 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSDA5PKW4 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSDA5PKW4 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSDA5PKW4 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSDA5PKW4 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSDA5PKW4 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSDA5PKW4 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSDA5PKW4 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSDA5PKW4 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSDA5PKW4 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSDA5PKW4 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSDA5PKW4 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSDA5PKW4 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSDA5PKW4 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSDA5PKW4 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PSDA5PKW4 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSDA5PKW4 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSDA5PKW4 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSDA5PKW4 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSDA5PKW4 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSDA5PKW4 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSDA5PKW4 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSDA5PKW4 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSDA5PKW4 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSDA5PKW4 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSDA5PKW4 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSDA5PKW4 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSDA5PKW4 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSDA5PKW4 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms