Protein–RNA interactions for Protein: A4D1S5

RAB19, Ras-related protein Rab-19, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB19A4D1S5 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB19A4D1S5 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB19A4D1S5 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB19A4D1S5 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB19A4D1S5 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB19A4D1S5 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB19A4D1S5 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB19A4D1S5 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB19A4D1S5 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB19A4D1S5 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB19A4D1S5 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB19A4D1S5 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB19A4D1S5 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB19A4D1S5 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB19A4D1S5 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB19A4D1S5 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB19A4D1S5 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB19A4D1S5 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB19A4D1S5 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB19A4D1S5 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB19A4D1S5 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB19A4D1S5 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB19A4D1S5 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB19A4D1S5 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB19A4D1S5 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB19A4D1S5 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB19A4D1S5 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB19A4D1S5 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB19A4D1S5 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB19A4D1S5 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB19A4D1S5 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB19A4D1S5 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB19A4D1S5 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB19A4D1S5 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB19A4D1S5 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB19A4D1S5 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB19A4D1S5 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB19A4D1S5 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB19A4D1S5 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB19A4D1S5 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB19A4D1S5 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB19A4D1S5 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB19A4D1S5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB19A4D1S5 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB19A4D1S5 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB19A4D1S5 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB19A4D1S5 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB19A4D1S5 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB19A4D1S5 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB19A4D1S5 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB19A4D1S5 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB19A4D1S5 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB19A4D1S5 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB19A4D1S5 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB19A4D1S5 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB19A4D1S5 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB19A4D1S5 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB19A4D1S5 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB19A4D1S5 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB19A4D1S5 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB19A4D1S5 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB19A4D1S5 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB19A4D1S5 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB19A4D1S5 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB19A4D1S5 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB19A4D1S5 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB19A4D1S5 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB19A4D1S5 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB19A4D1S5 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB19A4D1S5 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB19A4D1S5 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB19A4D1S5 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB19A4D1S5 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB19A4D1S5 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB19A4D1S5 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB19A4D1S5 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB19A4D1S5 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB19A4D1S5 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB19A4D1S5 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB19A4D1S5 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB19A4D1S5 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB19A4D1S5 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB19A4D1S5 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB19A4D1S5 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB19A4D1S5 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB19A4D1S5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB19A4D1S5 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB19A4D1S5 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB19A4D1S5 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB19A4D1S5 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB19A4D1S5 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB19A4D1S5 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB19A4D1S5 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB19A4D1S5 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB19A4D1S5 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB19A4D1S5 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB19A4D1S5 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB19A4D1S5 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB19A4D1S5 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB19A4D1S5 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms