Protein–RNA interactions for Protein: A2A3N6

PIPSL, Putative PIP5K1A and PSMD4-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIPSLA2A3N6 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms