Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
E2F8A0AVK6 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms