Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C0

NRXN3, Neurexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN3Q9Y4C0 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NRXN3Q9Y4C0 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NRXN3Q9Y4C0 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NRXN3Q9Y4C0 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NRXN3Q9Y4C0 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NRXN3Q9Y4C0 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NRXN3Q9Y4C0 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
NRXN3Q9Y4C0 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NRXN3Q9Y4C0 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
NRXN3Q9Y4C0 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NRXN3Q9Y4C0 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NRXN3Q9Y4C0 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NRXN3Q9Y4C0 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NRXN3Q9Y4C0 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NRXN3Q9Y4C0 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
NRXN3Q9Y4C0 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NRXN3Q9Y4C0 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NRXN3Q9Y4C0 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
NRXN3Q9Y4C0 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NRXN3Q9Y4C0 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NRXN3Q9Y4C0 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NRXN3Q9Y4C0 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NRXN3Q9Y4C0 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NRXN3Q9Y4C0 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NRXN3Q9Y4C0 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NRXN3Q9Y4C0 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NRXN3Q9Y4C0 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
NRXN3Q9Y4C0 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
NRXN3Q9Y4C0 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NRXN3Q9Y4C0 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NRXN3Q9Y4C0 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NRXN3Q9Y4C0 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
NRXN3Q9Y4C0 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NRXN3Q9Y4C0 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
NRXN3Q9Y4C0 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NRXN3Q9Y4C0 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NRXN3Q9Y4C0 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NRXN3Q9Y4C0 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NRXN3Q9Y4C0 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NRXN3Q9Y4C0 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NRXN3Q9Y4C0 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NRXN3Q9Y4C0 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NRXN3Q9Y4C0 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NRXN3Q9Y4C0 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NRXN3Q9Y4C0 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NRXN3Q9Y4C0 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NRXN3Q9Y4C0 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NRXN3Q9Y4C0 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NRXN3Q9Y4C0 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NRXN3Q9Y4C0 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
NRXN3Q9Y4C0 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
NRXN3Q9Y4C0 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NRXN3Q9Y4C0 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NRXN3Q9Y4C0 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NRXN3Q9Y4C0 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NRXN3Q9Y4C0 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NRXN3Q9Y4C0 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NRXN3Q9Y4C0 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NRXN3Q9Y4C0 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
NRXN3Q9Y4C0 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NRXN3Q9Y4C0 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NRXN3Q9Y4C0 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NRXN3Q9Y4C0 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NRXN3Q9Y4C0 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
NRXN3Q9Y4C0 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NRXN3Q9Y4C0 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NRXN3Q9Y4C0 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NRXN3Q9Y4C0 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NRXN3Q9Y4C0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NRXN3Q9Y4C0 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NRXN3Q9Y4C0 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NRXN3Q9Y4C0 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NRXN3Q9Y4C0 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
NRXN3Q9Y4C0 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NRXN3Q9Y4C0 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NRXN3Q9Y4C0 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
NRXN3Q9Y4C0 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NRXN3Q9Y4C0 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NRXN3Q9Y4C0 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NRXN3Q9Y4C0 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NRXN3Q9Y4C0 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NRXN3Q9Y4C0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NRXN3Q9Y4C0 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NRXN3Q9Y4C0 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NRXN3Q9Y4C0 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NRXN3Q9Y4C0 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
NRXN3Q9Y4C0 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NRXN3Q9Y4C0 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NRXN3Q9Y4C0 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NRXN3Q9Y4C0 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
NRXN3Q9Y4C0 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NRXN3Q9Y4C0 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NRXN3Q9Y4C0 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NRXN3Q9Y4C0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NRXN3Q9Y4C0 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
NRXN3Q9Y4C0 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NRXN3Q9Y4C0 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NRXN3Q9Y4C0 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NRXN3Q9Y4C0 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NRXN3Q9Y4C0 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms