Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y446

PKP3, Plakophilin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3Q9Y446 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PKP3Q9Y446 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PKP3Q9Y446 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PKP3Q9Y446 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PKP3Q9Y446 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PKP3Q9Y446 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PKP3Q9Y446 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PKP3Q9Y446 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PKP3Q9Y446 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PKP3Q9Y446 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PKP3Q9Y446 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PKP3Q9Y446 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PKP3Q9Y446 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PKP3Q9Y446 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PKP3Q9Y446 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PKP3Q9Y446 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PKP3Q9Y446 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PKP3Q9Y446 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PKP3Q9Y446 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PKP3Q9Y446 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PKP3Q9Y446 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PKP3Q9Y446 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PKP3Q9Y446 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PKP3Q9Y446 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PKP3Q9Y446 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PKP3Q9Y446 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PKP3Q9Y446 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PKP3Q9Y446 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PKP3Q9Y446 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PKP3Q9Y446 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PKP3Q9Y446 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PKP3Q9Y446 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PKP3Q9Y446 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PKP3Q9Y446 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PKP3Q9Y446 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PKP3Q9Y446 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PKP3Q9Y446 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PKP3Q9Y446 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PKP3Q9Y446 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PKP3Q9Y446 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PKP3Q9Y446 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PKP3Q9Y446 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PKP3Q9Y446 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PKP3Q9Y446 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PKP3Q9Y446 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PKP3Q9Y446 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PKP3Q9Y446 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PKP3Q9Y446 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PKP3Q9Y446 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PKP3Q9Y446 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PKP3Q9Y446 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PKP3Q9Y446 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PKP3Q9Y446 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PKP3Q9Y446 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PKP3Q9Y446 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PKP3Q9Y446 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PKP3Q9Y446 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PKP3Q9Y446 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PKP3Q9Y446 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PKP3Q9Y446 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PKP3Q9Y446 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PKP3Q9Y446 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PKP3Q9Y446 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PKP3Q9Y446 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PKP3Q9Y446 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PKP3Q9Y446 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PKP3Q9Y446 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PKP3Q9Y446 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PKP3Q9Y446 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PKP3Q9Y446 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PKP3Q9Y446 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PKP3Q9Y446 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PKP3Q9Y446 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PKP3Q9Y446 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PKP3Q9Y446 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PKP3Q9Y446 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PKP3Q9Y446 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms