Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B1

PRELID3B, PRELI domain containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRELID3BQ9Y3B1 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRELID3BQ9Y3B1 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms