Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH6

SNX7, Sorting nexin-7, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX7Q9UNH6 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX7Q9UNH6 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms