Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
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USP18Q9UMW8 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
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