Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM44

HHLA2, HERV-H LTR-associating protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA2Q9UM44 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HHLA2Q9UM44 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HHLA2Q9UM44 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HHLA2Q9UM44 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HHLA2Q9UM44 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HHLA2Q9UM44 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HHLA2Q9UM44 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HHLA2Q9UM44 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HHLA2Q9UM44 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HHLA2Q9UM44 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HHLA2Q9UM44 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HHLA2Q9UM44 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HHLA2Q9UM44 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HHLA2Q9UM44 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HHLA2Q9UM44 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HHLA2Q9UM44 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HHLA2Q9UM44 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HHLA2Q9UM44 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HHLA2Q9UM44 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HHLA2Q9UM44 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HHLA2Q9UM44 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HHLA2Q9UM44 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HHLA2Q9UM44 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HHLA2Q9UM44 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HHLA2Q9UM44 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HHLA2Q9UM44 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HHLA2Q9UM44 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HHLA2Q9UM44 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HHLA2Q9UM44 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HHLA2Q9UM44 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HHLA2Q9UM44 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HHLA2Q9UM44 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HHLA2Q9UM44 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HHLA2Q9UM44 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HHLA2Q9UM44 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HHLA2Q9UM44 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HHLA2Q9UM44 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HHLA2Q9UM44 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HHLA2Q9UM44 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HHLA2Q9UM44 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HHLA2Q9UM44 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HHLA2Q9UM44 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HHLA2Q9UM44 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HHLA2Q9UM44 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HHLA2Q9UM44 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HHLA2Q9UM44 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HHLA2Q9UM44 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HHLA2Q9UM44 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HHLA2Q9UM44 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HHLA2Q9UM44 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HHLA2Q9UM44 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HHLA2Q9UM44 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HHLA2Q9UM44 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HHLA2Q9UM44 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HHLA2Q9UM44 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HHLA2Q9UM44 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HHLA2Q9UM44 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HHLA2Q9UM44 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HHLA2Q9UM44 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HHLA2Q9UM44 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HHLA2Q9UM44 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HHLA2Q9UM44 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HHLA2Q9UM44 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HHLA2Q9UM44 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HHLA2Q9UM44 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HHLA2Q9UM44 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HHLA2Q9UM44 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HHLA2Q9UM44 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HHLA2Q9UM44 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HHLA2Q9UM44 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HHLA2Q9UM44 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HHLA2Q9UM44 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HHLA2Q9UM44 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HHLA2Q9UM44 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HHLA2Q9UM44 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HHLA2Q9UM44 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HHLA2Q9UM44 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HHLA2Q9UM44 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HHLA2Q9UM44 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HHLA2Q9UM44 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HHLA2Q9UM44 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HHLA2Q9UM44 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HHLA2Q9UM44 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HHLA2Q9UM44 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HHLA2Q9UM44 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HHLA2Q9UM44 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HHLA2Q9UM44 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HHLA2Q9UM44 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HHLA2Q9UM44 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HHLA2Q9UM44 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HHLA2Q9UM44 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HHLA2Q9UM44 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HHLA2Q9UM44 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HHLA2Q9UM44 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HHLA2Q9UM44 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HHLA2Q9UM44 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HHLA2Q9UM44 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HHLA2Q9UM44 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HHLA2Q9UM44 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HHLA2Q9UM44 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms