Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULN7

PNMA8B, Paraneoplastic antigen-like protein 8B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA8BQ9ULN7 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PNMA8BQ9ULN7 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PNMA8BQ9ULN7 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PNMA8BQ9ULN7 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PNMA8BQ9ULN7 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PNMA8BQ9ULN7 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PNMA8BQ9ULN7 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PNMA8BQ9ULN7 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PNMA8BQ9ULN7 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PNMA8BQ9ULN7 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PNMA8BQ9ULN7 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PNMA8BQ9ULN7 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PNMA8BQ9ULN7 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PNMA8BQ9ULN7 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PNMA8BQ9ULN7 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PNMA8BQ9ULN7 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PNMA8BQ9ULN7 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PNMA8BQ9ULN7 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PNMA8BQ9ULN7 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PNMA8BQ9ULN7 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PNMA8BQ9ULN7 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PNMA8BQ9ULN7 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PNMA8BQ9ULN7 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PNMA8BQ9ULN7 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PNMA8BQ9ULN7 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PNMA8BQ9ULN7 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PNMA8BQ9ULN7 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
PNMA8BQ9ULN7 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PNMA8BQ9ULN7 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PNMA8BQ9ULN7 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PNMA8BQ9ULN7 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PNMA8BQ9ULN7 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PNMA8BQ9ULN7 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PNMA8BQ9ULN7 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PNMA8BQ9ULN7 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PNMA8BQ9ULN7 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PNMA8BQ9ULN7 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PNMA8BQ9ULN7 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PNMA8BQ9ULN7 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PNMA8BQ9ULN7 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PNMA8BQ9ULN7 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PNMA8BQ9ULN7 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PNMA8BQ9ULN7 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PNMA8BQ9ULN7 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PNMA8BQ9ULN7 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PNMA8BQ9ULN7 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PNMA8BQ9ULN7 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PNMA8BQ9ULN7 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PNMA8BQ9ULN7 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PNMA8BQ9ULN7 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PNMA8BQ9ULN7 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PNMA8BQ9ULN7 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PNMA8BQ9ULN7 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PNMA8BQ9ULN7 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PNMA8BQ9ULN7 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PNMA8BQ9ULN7 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PNMA8BQ9ULN7 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PNMA8BQ9ULN7 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PNMA8BQ9ULN7 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PNMA8BQ9ULN7 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PNMA8BQ9ULN7 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PNMA8BQ9ULN7 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PNMA8BQ9ULN7 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PNMA8BQ9ULN7 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PNMA8BQ9ULN7 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PNMA8BQ9ULN7 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PNMA8BQ9ULN7 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PNMA8BQ9ULN7 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PNMA8BQ9ULN7 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PNMA8BQ9ULN7 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PNMA8BQ9ULN7 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PNMA8BQ9ULN7 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PNMA8BQ9ULN7 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PNMA8BQ9ULN7 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PNMA8BQ9ULN7 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PNMA8BQ9ULN7 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PNMA8BQ9ULN7 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PNMA8BQ9ULN7 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PNMA8BQ9ULN7 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PNMA8BQ9ULN7 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PNMA8BQ9ULN7 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PNMA8BQ9ULN7 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PNMA8BQ9ULN7 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PNMA8BQ9ULN7 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PNMA8BQ9ULN7 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PNMA8BQ9ULN7 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PNMA8BQ9ULN7 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PNMA8BQ9ULN7 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PNMA8BQ9ULN7 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PNMA8BQ9ULN7 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PNMA8BQ9ULN7 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PNMA8BQ9ULN7 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PNMA8BQ9ULN7 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PNMA8BQ9ULN7 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PNMA8BQ9ULN7 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PNMA8BQ9ULN7 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PNMA8BQ9ULN7 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PNMA8BQ9ULN7 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PNMA8BQ9ULN7 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PNMA8BQ9ULN7 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
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