Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULG1

INO80, DNA helicase INO80, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80Q9ULG1 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
INO80Q9ULG1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
INO80Q9ULG1 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
INO80Q9ULG1 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
INO80Q9ULG1 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
INO80Q9ULG1 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
INO80Q9ULG1 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
INO80Q9ULG1 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
INO80Q9ULG1 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
INO80Q9ULG1 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
INO80Q9ULG1 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
INO80Q9ULG1 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
INO80Q9ULG1 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
INO80Q9ULG1 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
INO80Q9ULG1 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
INO80Q9ULG1 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
INO80Q9ULG1 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
INO80Q9ULG1 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
INO80Q9ULG1 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
INO80Q9ULG1 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
INO80Q9ULG1 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
INO80Q9ULG1 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
INO80Q9ULG1 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
INO80Q9ULG1 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
INO80Q9ULG1 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
INO80Q9ULG1 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
INO80Q9ULG1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
INO80Q9ULG1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
INO80Q9ULG1 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
INO80Q9ULG1 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
INO80Q9ULG1 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
INO80Q9ULG1 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
INO80Q9ULG1 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
INO80Q9ULG1 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
INO80Q9ULG1 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
INO80Q9ULG1 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
INO80Q9ULG1 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
INO80Q9ULG1 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
INO80Q9ULG1 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
INO80Q9ULG1 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
INO80Q9ULG1 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
INO80Q9ULG1 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
INO80Q9ULG1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
INO80Q9ULG1 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
INO80Q9ULG1 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
INO80Q9ULG1 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
INO80Q9ULG1 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
INO80Q9ULG1 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
INO80Q9ULG1 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
INO80Q9ULG1 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
INO80Q9ULG1 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
INO80Q9ULG1 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
INO80Q9ULG1 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
INO80Q9ULG1 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
INO80Q9ULG1 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
INO80Q9ULG1 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
INO80Q9ULG1 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
INO80Q9ULG1 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
INO80Q9ULG1 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
INO80Q9ULG1 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
INO80Q9ULG1 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
INO80Q9ULG1 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
INO80Q9ULG1 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
INO80Q9ULG1 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
INO80Q9ULG1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
INO80Q9ULG1 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
INO80Q9ULG1 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
INO80Q9ULG1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
INO80Q9ULG1 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
INO80Q9ULG1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
INO80Q9ULG1 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
INO80Q9ULG1 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
INO80Q9ULG1 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
INO80Q9ULG1 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
INO80Q9ULG1 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
INO80Q9ULG1 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
INO80Q9ULG1 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
INO80Q9ULG1 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
INO80Q9ULG1 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
INO80Q9ULG1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
INO80Q9ULG1 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
INO80Q9ULG1 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
INO80Q9ULG1 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
INO80Q9ULG1 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
INO80Q9ULG1 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
INO80Q9ULG1 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
INO80Q9ULG1 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
INO80Q9ULG1 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
INO80Q9ULG1 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
INO80Q9ULG1 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
INO80Q9ULG1 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
INO80Q9ULG1 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
INO80Q9ULG1 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
INO80Q9ULG1 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
INO80Q9ULG1 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
INO80Q9ULG1 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
INO80Q9ULG1 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
INO80Q9ULG1 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
INO80Q9ULG1 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
INO80Q9ULG1 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms