Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ4

SALL4, Sal-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL4Q9UJQ4 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SALL4Q9UJQ4 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SALL4Q9UJQ4 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SALL4Q9UJQ4 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SALL4Q9UJQ4 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SALL4Q9UJQ4 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SALL4Q9UJQ4 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SALL4Q9UJQ4 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SALL4Q9UJQ4 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SALL4Q9UJQ4 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SALL4Q9UJQ4 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SALL4Q9UJQ4 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SALL4Q9UJQ4 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SALL4Q9UJQ4 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SALL4Q9UJQ4 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SALL4Q9UJQ4 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SALL4Q9UJQ4 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SALL4Q9UJQ4 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SALL4Q9UJQ4 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SALL4Q9UJQ4 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SALL4Q9UJQ4 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SALL4Q9UJQ4 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SALL4Q9UJQ4 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SALL4Q9UJQ4 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SALL4Q9UJQ4 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SALL4Q9UJQ4 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SALL4Q9UJQ4 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SALL4Q9UJQ4 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SALL4Q9UJQ4 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SALL4Q9UJQ4 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SALL4Q9UJQ4 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SALL4Q9UJQ4 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SALL4Q9UJQ4 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SALL4Q9UJQ4 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SALL4Q9UJQ4 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SALL4Q9UJQ4 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SALL4Q9UJQ4 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SALL4Q9UJQ4 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SALL4Q9UJQ4 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SALL4Q9UJQ4 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SALL4Q9UJQ4 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SALL4Q9UJQ4 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SALL4Q9UJQ4 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SALL4Q9UJQ4 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SALL4Q9UJQ4 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SALL4Q9UJQ4 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SALL4Q9UJQ4 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SALL4Q9UJQ4 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SALL4Q9UJQ4 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SALL4Q9UJQ4 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SALL4Q9UJQ4 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SALL4Q9UJQ4 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SALL4Q9UJQ4 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SALL4Q9UJQ4 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SALL4Q9UJQ4 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SALL4Q9UJQ4 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SALL4Q9UJQ4 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SALL4Q9UJQ4 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SALL4Q9UJQ4 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SALL4Q9UJQ4 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SALL4Q9UJQ4 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SALL4Q9UJQ4 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SALL4Q9UJQ4 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SALL4Q9UJQ4 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SALL4Q9UJQ4 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SALL4Q9UJQ4 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SALL4Q9UJQ4 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SALL4Q9UJQ4 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SALL4Q9UJQ4 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SALL4Q9UJQ4 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SALL4Q9UJQ4 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SALL4Q9UJQ4 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SALL4Q9UJQ4 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SALL4Q9UJQ4 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SALL4Q9UJQ4 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SALL4Q9UJQ4 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SALL4Q9UJQ4 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SALL4Q9UJQ4 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SALL4Q9UJQ4 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SALL4Q9UJQ4 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SALL4Q9UJQ4 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SALL4Q9UJQ4 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SALL4Q9UJQ4 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SALL4Q9UJQ4 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SALL4Q9UJQ4 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SALL4Q9UJQ4 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SALL4Q9UJQ4 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SALL4Q9UJQ4 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SALL4Q9UJQ4 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SALL4Q9UJQ4 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SALL4Q9UJQ4 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SALL4Q9UJQ4 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SALL4Q9UJQ4 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SALL4Q9UJQ4 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SALL4Q9UJQ4 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SALL4Q9UJQ4 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SALL4Q9UJQ4 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SALL4Q9UJQ4 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SALL4Q9UJQ4 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SALL4Q9UJQ4 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms