Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms