Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHA2

SS18L2, SS18-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18L2Q9UHA2 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SS18L2Q9UHA2 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SS18L2Q9UHA2 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SS18L2Q9UHA2 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SS18L2Q9UHA2 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SS18L2Q9UHA2 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SS18L2Q9UHA2 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SS18L2Q9UHA2 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SS18L2Q9UHA2 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SS18L2Q9UHA2 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SS18L2Q9UHA2 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SS18L2Q9UHA2 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SS18L2Q9UHA2 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SS18L2Q9UHA2 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SS18L2Q9UHA2 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SS18L2Q9UHA2 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SS18L2Q9UHA2 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SS18L2Q9UHA2 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SS18L2Q9UHA2 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SS18L2Q9UHA2 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SS18L2Q9UHA2 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SS18L2Q9UHA2 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SS18L2Q9UHA2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SS18L2Q9UHA2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
SS18L2Q9UHA2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
SS18L2Q9UHA2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SS18L2Q9UHA2 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SS18L2Q9UHA2 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SS18L2Q9UHA2 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SS18L2Q9UHA2 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SS18L2Q9UHA2 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SS18L2Q9UHA2 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SS18L2Q9UHA2 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SS18L2Q9UHA2 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SS18L2Q9UHA2 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SS18L2Q9UHA2 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SS18L2Q9UHA2 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SS18L2Q9UHA2 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SS18L2Q9UHA2 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SS18L2Q9UHA2 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SS18L2Q9UHA2 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SS18L2Q9UHA2 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SS18L2Q9UHA2 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SS18L2Q9UHA2 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SS18L2Q9UHA2 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SS18L2Q9UHA2 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SS18L2Q9UHA2 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SS18L2Q9UHA2 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SS18L2Q9UHA2 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SS18L2Q9UHA2 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SS18L2Q9UHA2 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SS18L2Q9UHA2 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SS18L2Q9UHA2 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SS18L2Q9UHA2 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SS18L2Q9UHA2 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SS18L2Q9UHA2 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SS18L2Q9UHA2 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SS18L2Q9UHA2 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SS18L2Q9UHA2 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SS18L2Q9UHA2 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SS18L2Q9UHA2 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SS18L2Q9UHA2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SS18L2Q9UHA2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SS18L2Q9UHA2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SS18L2Q9UHA2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SS18L2Q9UHA2 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SS18L2Q9UHA2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SS18L2Q9UHA2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SS18L2Q9UHA2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SS18L2Q9UHA2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SS18L2Q9UHA2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SS18L2Q9UHA2 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SS18L2Q9UHA2 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SS18L2Q9UHA2 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
SS18L2Q9UHA2 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SS18L2Q9UHA2 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SS18L2Q9UHA2 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SS18L2Q9UHA2 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SS18L2Q9UHA2 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SS18L2Q9UHA2 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SS18L2Q9UHA2 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SS18L2Q9UHA2 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SS18L2Q9UHA2 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SS18L2Q9UHA2 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SS18L2Q9UHA2 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SS18L2Q9UHA2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SS18L2Q9UHA2 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SS18L2Q9UHA2 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SS18L2Q9UHA2 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SS18L2Q9UHA2 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SS18L2Q9UHA2 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SS18L2Q9UHA2 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SS18L2Q9UHA2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SS18L2Q9UHA2 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SS18L2Q9UHA2 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
SS18L2Q9UHA2 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SS18L2Q9UHA2 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SS18L2Q9UHA2 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SS18L2Q9UHA2 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SS18L2Q9UHA2 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms