Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms