Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEU0

VTI1B, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1BQ9UEU0 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms