Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX2

DUX4, Double homeobox protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4Q9UBX2 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUX4Q9UBX2 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DUX4Q9UBX2 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
DUX4Q9UBX2 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DUX4Q9UBX2 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DUX4Q9UBX2 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DUX4Q9UBX2 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DUX4Q9UBX2 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DUX4Q9UBX2 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DUX4Q9UBX2 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DUX4Q9UBX2 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DUX4Q9UBX2 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DUX4Q9UBX2 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DUX4Q9UBX2 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DUX4Q9UBX2 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DUX4Q9UBX2 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DUX4Q9UBX2 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DUX4Q9UBX2 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DUX4Q9UBX2 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms