Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLKQ9UBT6 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLKQ9UBT6 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLKQ9UBT6 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
POLKQ9UBT6 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLKQ9UBT6 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLKQ9UBT6 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLKQ9UBT6 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLKQ9UBT6 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLKQ9UBT6 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLKQ9UBT6 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLKQ9UBT6 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLKQ9UBT6 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLKQ9UBT6 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLKQ9UBT6 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLKQ9UBT6 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLKQ9UBT6 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLKQ9UBT6 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLKQ9UBT6 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLKQ9UBT6 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLKQ9UBT6 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLKQ9UBT6 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLKQ9UBT6 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLKQ9UBT6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
POLKQ9UBT6 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
POLKQ9UBT6 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
POLKQ9UBT6 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
POLKQ9UBT6 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
POLKQ9UBT6 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
POLKQ9UBT6 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
POLKQ9UBT6 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
POLKQ9UBT6 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
POLKQ9UBT6 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.6
POLKQ9UBT6 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
POLKQ9UBT6 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLKQ9UBT6 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLKQ9UBT6 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLKQ9UBT6 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLKQ9UBT6 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLKQ9UBT6 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLKQ9UBT6 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLKQ9UBT6 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLKQ9UBT6 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLKQ9UBT6 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLKQ9UBT6 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLKQ9UBT6 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLKQ9UBT6 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLKQ9UBT6 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLKQ9UBT6 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLKQ9UBT6 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
POLKQ9UBT6 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
POLKQ9UBT6 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLKQ9UBT6 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLKQ9UBT6 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLKQ9UBT6 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLKQ9UBT6 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
POLKQ9UBT6 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLKQ9UBT6 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLKQ9UBT6 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLKQ9UBT6 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLKQ9UBT6 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
POLKQ9UBT6 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLKQ9UBT6 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
POLKQ9UBT6 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLKQ9UBT6 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLKQ9UBT6 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLKQ9UBT6 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLKQ9UBT6 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLKQ9UBT6 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
POLKQ9UBT6 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLKQ9UBT6 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLKQ9UBT6 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLKQ9UBT6 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLKQ9UBT6 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLKQ9UBT6 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLKQ9UBT6 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLKQ9UBT6 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLKQ9UBT6 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLKQ9UBT6 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLKQ9UBT6 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLKQ9UBT6 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLKQ9UBT6 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLKQ9UBT6 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
POLKQ9UBT6 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLKQ9UBT6 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLKQ9UBT6 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLKQ9UBT6 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLKQ9UBT6 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLKQ9UBT6 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLKQ9UBT6 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLKQ9UBT6 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLKQ9UBT6 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLKQ9UBT6 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLKQ9UBT6 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
POLKQ9UBT6 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
POLKQ9UBT6 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLKQ9UBT6 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLKQ9UBT6 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLKQ9UBT6 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLKQ9UBT6 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms