Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPASTQ9UBP0 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPASTQ9UBP0 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPASTQ9UBP0 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPASTQ9UBP0 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPASTQ9UBP0 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPASTQ9UBP0 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPASTQ9UBP0 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPASTQ9UBP0 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPASTQ9UBP0 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPASTQ9UBP0 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPASTQ9UBP0 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPASTQ9UBP0 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPASTQ9UBP0 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPASTQ9UBP0 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPASTQ9UBP0 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPASTQ9UBP0 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPASTQ9UBP0 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPASTQ9UBP0 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPASTQ9UBP0 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPASTQ9UBP0 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPASTQ9UBP0 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPASTQ9UBP0 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SPASTQ9UBP0 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SPASTQ9UBP0 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPASTQ9UBP0 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPASTQ9UBP0 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPASTQ9UBP0 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPASTQ9UBP0 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPASTQ9UBP0 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPASTQ9UBP0 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPASTQ9UBP0 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPASTQ9UBP0 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPASTQ9UBP0 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPASTQ9UBP0 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.58
SPASTQ9UBP0 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPASTQ9UBP0 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPASTQ9UBP0 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPASTQ9UBP0 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPASTQ9UBP0 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPASTQ9UBP0 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPASTQ9UBP0 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPASTQ9UBP0 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPASTQ9UBP0 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPASTQ9UBP0 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPASTQ9UBP0 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPASTQ9UBP0 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPASTQ9UBP0 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPASTQ9UBP0 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPASTQ9UBP0 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPASTQ9UBP0 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPASTQ9UBP0 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPASTQ9UBP0 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPASTQ9UBP0 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPASTQ9UBP0 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPASTQ9UBP0 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPASTQ9UBP0 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPASTQ9UBP0 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SPASTQ9UBP0 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPASTQ9UBP0 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPASTQ9UBP0 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPASTQ9UBP0 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPASTQ9UBP0 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPASTQ9UBP0 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPASTQ9UBP0 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPASTQ9UBP0 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPASTQ9UBP0 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPASTQ9UBP0 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPASTQ9UBP0 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPASTQ9UBP0 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPASTQ9UBP0 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPASTQ9UBP0 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPASTQ9UBP0 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPASTQ9UBP0 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPASTQ9UBP0 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPASTQ9UBP0 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPASTQ9UBP0 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SPASTQ9UBP0 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPASTQ9UBP0 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPASTQ9UBP0 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPASTQ9UBP0 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPASTQ9UBP0 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPASTQ9UBP0 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SPASTQ9UBP0 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPASTQ9UBP0 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPASTQ9UBP0 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPASTQ9UBP0 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPASTQ9UBP0 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPASTQ9UBP0 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPASTQ9UBP0 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPASTQ9UBP0 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPASTQ9UBP0 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPASTQ9UBP0 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPASTQ9UBP0 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPASTQ9UBP0 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPASTQ9UBP0 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPASTQ9UBP0 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPASTQ9UBP0 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPASTQ9UBP0 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPASTQ9UBP0 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms