Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE8

CWC25, Pre-mRNA-splicing factor CWC25 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC25Q9NXE8 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CWC25Q9NXE8 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CWC25Q9NXE8 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CWC25Q9NXE8 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CWC25Q9NXE8 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CWC25Q9NXE8 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CWC25Q9NXE8 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CWC25Q9NXE8 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CWC25Q9NXE8 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CWC25Q9NXE8 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CWC25Q9NXE8 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CWC25Q9NXE8 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CWC25Q9NXE8 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CWC25Q9NXE8 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CWC25Q9NXE8 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CWC25Q9NXE8 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CWC25Q9NXE8 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CWC25Q9NXE8 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CWC25Q9NXE8 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CWC25Q9NXE8 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CWC25Q9NXE8 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CWC25Q9NXE8 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CWC25Q9NXE8 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CWC25Q9NXE8 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CWC25Q9NXE8 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CWC25Q9NXE8 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CWC25Q9NXE8 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CWC25Q9NXE8 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CWC25Q9NXE8 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CWC25Q9NXE8 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CWC25Q9NXE8 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CWC25Q9NXE8 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CWC25Q9NXE8 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CWC25Q9NXE8 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CWC25Q9NXE8 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CWC25Q9NXE8 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CWC25Q9NXE8 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CWC25Q9NXE8 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CWC25Q9NXE8 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CWC25Q9NXE8 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CWC25Q9NXE8 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CWC25Q9NXE8 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CWC25Q9NXE8 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CWC25Q9NXE8 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CWC25Q9NXE8 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CWC25Q9NXE8 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CWC25Q9NXE8 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CWC25Q9NXE8 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CWC25Q9NXE8 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CWC25Q9NXE8 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CWC25Q9NXE8 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CWC25Q9NXE8 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CWC25Q9NXE8 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CWC25Q9NXE8 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CWC25Q9NXE8 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CWC25Q9NXE8 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CWC25Q9NXE8 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CWC25Q9NXE8 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CWC25Q9NXE8 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CWC25Q9NXE8 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CWC25Q9NXE8 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CWC25Q9NXE8 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CWC25Q9NXE8 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CWC25Q9NXE8 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CWC25Q9NXE8 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CWC25Q9NXE8 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CWC25Q9NXE8 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CWC25Q9NXE8 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CWC25Q9NXE8 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CWC25Q9NXE8 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CWC25Q9NXE8 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CWC25Q9NXE8 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CWC25Q9NXE8 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CWC25Q9NXE8 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CWC25Q9NXE8 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CWC25Q9NXE8 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CWC25Q9NXE8 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CWC25Q9NXE8 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CWC25Q9NXE8 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CWC25Q9NXE8 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CWC25Q9NXE8 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CWC25Q9NXE8 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CWC25Q9NXE8 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CWC25Q9NXE8 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CWC25Q9NXE8 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CWC25Q9NXE8 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CWC25Q9NXE8 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CWC25Q9NXE8 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CWC25Q9NXE8 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CWC25Q9NXE8 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CWC25Q9NXE8 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CWC25Q9NXE8 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CWC25Q9NXE8 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CWC25Q9NXE8 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CWC25Q9NXE8 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CWC25Q9NXE8 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CWC25Q9NXE8 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CWC25Q9NXE8 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CWC25Q9NXE8 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CWC25Q9NXE8 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms