Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSE7

ABCC13, Putative ATP-binding cassette sub-family C member 13, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC13Q9NSE7 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ABCC13Q9NSE7 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ABCC13Q9NSE7 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ABCC13Q9NSE7 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ABCC13Q9NSE7 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ABCC13Q9NSE7 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ABCC13Q9NSE7 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ABCC13Q9NSE7 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ABCC13Q9NSE7 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ABCC13Q9NSE7 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ABCC13Q9NSE7 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ABCC13Q9NSE7 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ABCC13Q9NSE7 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ABCC13Q9NSE7 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ABCC13Q9NSE7 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ABCC13Q9NSE7 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ABCC13Q9NSE7 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ABCC13Q9NSE7 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ABCC13Q9NSE7 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ABCC13Q9NSE7 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ABCC13Q9NSE7 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ABCC13Q9NSE7 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ABCC13Q9NSE7 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ABCC13Q9NSE7 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ABCC13Q9NSE7 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ABCC13Q9NSE7 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ABCC13Q9NSE7 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ABCC13Q9NSE7 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ABCC13Q9NSE7 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ABCC13Q9NSE7 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ABCC13Q9NSE7 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ABCC13Q9NSE7 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ABCC13Q9NSE7 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ABCC13Q9NSE7 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ABCC13Q9NSE7 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ABCC13Q9NSE7 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ABCC13Q9NSE7 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ABCC13Q9NSE7 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ABCC13Q9NSE7 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ABCC13Q9NSE7 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ABCC13Q9NSE7 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ABCC13Q9NSE7 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ABCC13Q9NSE7 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ABCC13Q9NSE7 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ABCC13Q9NSE7 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ABCC13Q9NSE7 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ABCC13Q9NSE7 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ABCC13Q9NSE7 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ABCC13Q9NSE7 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ABCC13Q9NSE7 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ABCC13Q9NSE7 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ABCC13Q9NSE7 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ABCC13Q9NSE7 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ABCC13Q9NSE7 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ABCC13Q9NSE7 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ABCC13Q9NSE7 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ABCC13Q9NSE7 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ABCC13Q9NSE7 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ABCC13Q9NSE7 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ABCC13Q9NSE7 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ABCC13Q9NSE7 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ABCC13Q9NSE7 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ABCC13Q9NSE7 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ABCC13Q9NSE7 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ABCC13Q9NSE7 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ABCC13Q9NSE7 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ABCC13Q9NSE7 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ABCC13Q9NSE7 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ABCC13Q9NSE7 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ABCC13Q9NSE7 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ABCC13Q9NSE7 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ABCC13Q9NSE7 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ABCC13Q9NSE7 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ABCC13Q9NSE7 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ABCC13Q9NSE7 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ABCC13Q9NSE7 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ABCC13Q9NSE7 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ABCC13Q9NSE7 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ABCC13Q9NSE7 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ABCC13Q9NSE7 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ABCC13Q9NSE7 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ABCC13Q9NSE7 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ABCC13Q9NSE7 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ABCC13Q9NSE7 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ABCC13Q9NSE7 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ABCC13Q9NSE7 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ABCC13Q9NSE7 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ABCC13Q9NSE7 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ABCC13Q9NSE7 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ABCC13Q9NSE7 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ABCC13Q9NSE7 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ABCC13Q9NSE7 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ABCC13Q9NSE7 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ABCC13Q9NSE7 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ABCC13Q9NSE7 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ABCC13Q9NSE7 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ABCC13Q9NSE7 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ABCC13Q9NSE7 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ABCC13Q9NSE7 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ABCC13Q9NSE7 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms