Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms