Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF2

SH2B1, SH2B adapter protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2B1Q9NRF2 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms